Products
产品线类别
10x Genomics 产品
Chromium 单细胞基因表达
时间:2022-12-01点击:1214

11-2022.8.4新改-文字居中版.jpeg


Resources:     获取报价                      观看工作原理                    下载产品说明                 经费申请写作协助                     单细胞购买指南

 

Chromium单细胞基因表达解决方案能够提供单细胞转录组3'基因表达和多组学功能,可同时对成千上万个细胞进行分析。通过结合单细胞水平的基因表达、细胞表面蛋白表达或CRISPR编辑,可以探索细胞异质性,鉴定新的靶点及生物标志物。


1659510634115979.png

高通量单细胞分析

1659511014902806.png

多组学细胞读数

1659511210136948.png

可扩展的功能基因组学

捕获样本中成千上万个细胞的完整异质性。

可检测3’ mRNA、细胞表面蛋白、CRISPR扰动及其他。

通过配对的CRISPR敲除和全转录组读数来探索基因网络。

1659510812231597.png

简化的数据分析

1659511032136126.png

为期一天的实验室流程

1659511260856117.png

兼容不同的样本

使用易用的软件来探索和解释单细胞基因表达谱。在一天之内完成从样本到可测序文库的过程。经验证适用于固定、新鲜和冷冻的样本,以及完整的细胞和细胞核。


通过单细胞多组学探索您的应用



灵活的解决方案 满足您各种需求

1.png


单细胞基因表达的标准


Chromium单细胞基因表达解决方案可以满足您的各种需求--从处理大型项目到发现基因表达的多样性,逐个细胞地进行解析。


2.png




获得初步见解

开启您的单细胞基因表达实验--使用可以负担的适用于小型项目的解决方案进行试点研究或优化实验条件。

单细胞基因表达低通量解决方案

2.png

开启您的单细胞发现之旅。仅需100-1,000个细胞即可进行试点研究,启动初步研究或进行样本制备优化。
观看产品网络研讨会 >


获得初步见解


优化样本制备


从样本制备到数据分析的全面支持

通过小规模研究,从100-1,000个细胞中找到可揭示的内容


优化实验条件,提高您的研究成功率。

从技术资源到用户友好的基于云的数据分析都将为您提供端到端的支持。





多组学分析

同时测量细胞表面蛋白表达或CRISPR扰动与基因表达。

CRISPR筛选                                                     2.png

通过对细胞内sgRNA的直接捕获和基因表达的变化,以单细胞分辨率评估CRISPR扰动带来的影响。

查看信息图 >
1659517086582521.png
  • 筛选与疾病相关的新型基因靶点或耐药性的驱动因素

  • 通过更快的流程和更高的分辨率开展功能性遗传筛选

  • 揭示发育过程中复杂的基因调控通路

观看CRISPR网络研讨会 >


细胞表面蛋白
 

                                                     2.png

综合分析单细胞的基因和蛋白表达,以便发现新的细胞亚群和罕见的细胞群体。

1659577619103964.png
  • 通过额外的蛋白信息来丰富对不同细胞表型的认识

  • 通过同步的单细胞检测来探索转录组与蛋白组之间的关系

下载应用指南 >







单细胞固定RNA分析

固定RNA分析能够提供单细胞基因表达和混样功能,以分析数百到一百万个细胞。在样本采集点进行固定可保留脆弱样本的生物学特征,并大大简化工作流程,带来更多样本的生物学见解。

观看相关网络研讨会 >   

                                                                                                          2.png



                                                          

自动化工作流程

通过Chromium Connect 单细胞基因表达解决方案获得一致性高、重复性好的结果,大大提高实验室生产力。

自动化单细胞基因表达解决方案



基于Chromium Connect的自动化基因表达工作流程,助力您探索异质性,发现新的目标和生物标志物,并以提高生产力来揭示复杂的细胞过程。2.png


优化生产力

将您的工作流程标准化

流线操作

缩短手动操作时间,从单细胞到可以测序的基因表达文库,实现无人值守的便捷。

在多个实验室、用户、甚至多个站点生成一致且可重复的单细胞基因表达结果。

采用预先分装的自动化专属试剂,这些试剂采用颜色编码和2D条形码,用于防错试剂跟踪和加载。


完整的解决方案

1660291145122782.png


基于Next GEM技术的Chromium仪器

    Chromium X Series

    通量灵活、可拓展

    Chromium Controller

    小巧灵活

    Chromium Connect

    自动化


1660291239523051.png 

   Chromium单细胞基因表达试剂

   利用我们的试剂盒,您可以捕获和扩增3’

   mRNA,鉴定CRISPR扰动或开展其他应用。


1660291342643712.png


     分析和可视化软件

        

         Cell Ranger

         数据分析流程

         Loupe Browser

         数据可视化软件


1660291990361466.png


  世界级的技术支持和客户支持


  您可以通过电话或电子邮件联系我们的 专家支持团队。


工作流程

单细胞基因表达的基本工作流程如下所示。若您使用我们的Feature Barcode试剂盒来分析CRISPR或细胞表面蛋白,我们将会提供其他方案用于修饰您感兴趣的蛋白。




1662001807287366.png


样本制备


从成百上千个细胞开始。按照洗涤、计数和浓缩细胞的高效做法,尽量减少细胞团块的存在,回收高质量的单细胞悬液。



1662010011124379.png

文库构建


利用我们的试剂盒和Chromium Controller构建带有10x条形码的文库。 Chromium Controller将每个带有10x条形码的凝胶珠的细胞封装在单个液滴中。在每个纳升级的液滴中,细胞经过逆转录生成cDNA,其中单个细胞的所有cDNA都带有共同的10x条形码。




1662013396108775.png

测序


第2步所生成的10x条形码文库与Illumina测序仪上的标准短读长NGS测序兼容,能够实现数千个单细胞的大规模转录分析。


1662014972262450.png


据分析


我们的Cell Ranger分析软件可生成每个细胞的表达谱,鉴定表达谱相似的细胞簇,还能够对多个样本的数据进行合并分析。


分析流程输出

输出结果包括质控信息和文件,这些文件可轻松用于Loupe可视化软件或第三方R工具及Python工具的进一步分析。



1662015489723019.png

数据可视化


利用我们的Loupe Browser可视化软件,您可以交互式地探索实验结果,研究目的基因的表达模式,确定细胞类型,并开展细胞簇和样本之间的比较分析。


只有生物信息专家才能使用吗?

Loupe是点选式软件,任何人都可以轻松下载和使用。






常 见 问 题

  • Chromium单细胞基因表达能够实现哪种分析?

    它提供了一种全面的方法,来分析基因表达(全转录组或靶向),以及细胞表面蛋白或CRISPR编辑对复杂生物学的多维见解。

  • 能够分析哪些类型的RNA?

    只要是表达聚腺苷酸化mRNA分子的细胞类型,都与该单细胞RNA-seq流程兼容。

  • 与哪些类型的样本兼容?

    Chromium单细胞基因表达与新鲜、固定(甲醇)和冷冻的单细胞或单细胞核悬液兼容。兼容的物种包括人、小鼠、大鼠、模式生物以及植物。

  • 如何分析我的单细胞数据?

    10x Genomics提供了两种类型的软件,可帮助您分析数据:Cell Ranger和Loupe Browser。Cell Ranger这款分析软件能够自动生成每个细胞的表达谱,并鉴定表达谱相似的细胞簇。随后,您可以利用Loupe Browser可视化软件来交互式地探索实验结果。您可以从10x支持网站上免费下载Cell Ranger和Loupe Browser。

  • 细胞大小是否存在限制?

    我们在内部测试了直径达到30微米的细胞。此外,许多客户文献也成功证明了对各类细胞的兼容性,如肝细胞、成纤维细胞和心肌细胞,它们的大小往往超过30微米。


相 关 产 品


  产品


 单细胞基因表达


 

   单细胞免疫分析

 

   空间基因表达

 

   单细胞ATAC

  性能
  •   3’转录组基因在组织中的表达

  •   靶向基因表达

  •   多样本混合检测

  •   全长配对的TCR/BCR序列

  •   5’全转录组基因表达

  •   靶向基因表达

  •   3’转录组基因在组织中的表达

  •   靶向基因表达

  •   兼容FFPE组织切片和新鲜冷冻组织切片

  •   通过开放染色质分析进行表观基因组学研究

  扩展应用
  •   细胞表面蛋白

  •   CRISPR筛选

  •   多样本混合检测

  •   细胞表面蛋白

  •   抗原特异性

  •   CRISPR筛选

  •   免疫荧光蛋白共检测

  •   –

  仪器
  •   Chromium X系列单细胞系统

  •   Chromium Controller

  •   Chromium Connect

  •   Chromium X系列单细胞系统

  •   Chromium Controller

  •   Chromium Connect

  •    Visium CytAssist

  •   Chromium X系列单细胞系统

  •   Chromium Controller

1662088162307203.png



友情链接:      10x Genomics官网                    10x单细胞基因表达                     10x技术支持                     10x视频中心